新生儿父母不在同一户口本，需办理相关手续确认亲子关系。分析：根据我国户籍管理规定，新生儿落户通常需依据其父母的户籍情况。若父母不在同一户口本，可能需通过出生证明、亲子鉴定等方式确认亲子关系，并依据当地政策选择落户父亲或母亲一方。提醒：若新生儿无法及时落户，或面临户籍管理部门的拒绝，表明问题较严重，应及时咨询律师或户籍管理部门。
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处理方式：从法律角度，处理此类问题常见方式有：提交出生证明、进行亲子鉴定、咨询户籍管理部门、寻求法律援助等。选择方式时，需考虑效率、成本、风险等因素。如出生证明齐全，可直接提交；若存在争议，则需亲子鉴定；若对政策有疑问，可咨询户籍部门；若遇法律难题，应寻求律师帮助。
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具体操作：1.若出生证明齐全且能证明亲子关系，可直接携带出生证明、父母身份证等材料，前往户籍管理部门办理新生儿落户。2.若无法直接证明亲子关系，需进行亲子鉴定，凭鉴定结果及父母身份证等材料办理落户。3.在办理过程中，如遇户籍管理部门拒绝或要求不合理材料，可咨询律师或法律援助机构，了解相关政策和法律规定，确保合法权益。4.如因特殊情况无法落户，如父母一方为外籍或存在户籍迁移等问题，需咨询律师，了解具体解决方案。